Поймите, что каждый ЯП требует своего подхода. На Julia просто невозможен монолитный крупный проект. На C++ или Java - это нормальная практика. Сама идеология разработки на Julia - это функционально ограниченный пакет, внутри которого есть ограниченное количество модулей (не файлов). Вы собираете большой проект из автономных пакетов. И вы не сможете сделать пакет, если не разработали для него модульные тесты. А сама схема разбиения на пакеты - это функциональная декомпозиция. Если она выполнена по-человечески, то назначение пакета установить несложно.

Для разработки в Julia есть VS Code. И то, что пошаговым отладчиком пользоваться неудобно (он просто очень медленный), не исключает возможность по-строчного запуска кода с визуализацией значений переменных. Но это не пошаговая отладка, а отладка по результатам вызова функций. По произвольному коду. И без пошагового отладчика, отладка в целом выполняется без каких-либо затруднений.