(Сразу скажу, что моё мнение основано на чтение блогов, людей, причастных к.)Выглядит так, что MariaDB к сожалению постепенно отходит от MySQL в совсем уж самостоятельный форк. Другими словами, эти две системы быстро отходят друг от друга по фичам, и через некоторое время (если уже не) MariaDB перестанет быть тем самым "drop-in replacement" для MySQL, а это сильно сУзит область её применения.
То есть мне, например, сильно импонирует то, что MariaDB разрабатывается существенно более открыто (MySQL разрабатывается методом перекидывания релизов через забор; багтрекер закрыт для пользователей без support-контракта с Ораклом), но для большнства людей MySQL это именно MySQL, а не MariaDB, а значит вполне можно ожидать что скоро какой-нибудь там Астериск или, там, очередная CMS или CRM с MariaDB *вместо* MySQL уже не заработает.
Если же Вы выбираете RDBMS под свои собственные нужды (под свою разработку), то нет смысла задавать вопрос, который Вы задаёте: вместо этого изучите наборы фич каждой реализации в версиях под вашу целевую ОС, сравните производительность тестами. Заодно и на постгрес посмотрите, например.