В новой версии не добавлено новых возможностей, а только исправлены (http://groups-beta.google.com/group/mailing.unix.openssh-dev...) около 10 несущественных ошибок,  среди которых есть приводящие, при определенных обстоятельствах, к обрыву соединения и краху ssh.

URL: http://groups-beta.google.com/group/mailing.unix.openssh-dev...
Новость: http://www.opennet.me/opennews/art.shtml?num=5532

• OpenSSh 4.1 - релиз с исправлением ошибок,Artem, 22:29 , 28-Май-05
  • OpenSSh 4.1 - релиз с исправлением ошибок,rost, 22:49 , 28-Май-05
• OpenSSh 4.1 - релиз с исправлением ошибок,McLone, 01:02 , 29-Май-05
• OpenSSh 4.1 - релиз с исправлением ошибок,HFSC, 12:22 , 29-Май-05

И как првильно его обновить на Frebsd 5.3?

имхо, свежий софт лучше ставить из портов

cd /usr/ports/sysutils/portupgrade && make deinstall install clean

portupgrade -aprRkDN security/openssh-portable

McLone выдыхай ))