Требования для научных статей: microsoft word 2003 и недавно разрешили docx. ПДФ ваш они в одном месте видели. Особенно если такие умники приносят их с растровыми иллюстрациями.
ПДФ - это уже рендер документа. Он нужен на печать, а не на вёрстку. Если надо менять стили, редактировать картинки, разбивать колонки, етц, етц, то с херовым ПДФом маразма больше чем с любым доком. Кроме того, док в пдф - 2 секунды, пдф в док - невозможно. Так что, в 90% случаев "крутых" пдф-щиков и юных ТеХ-ников посылают в return;