> и где его взять? В секундах еще понимаю, хотя это тоже конечно пердолинг.

Было бы в секундах, "ну и как я ему точное начало сцены укажу", "что значит у меня timestamp'ы не с нуля", "что за чёрное окошко, где мои гуи".

Так работает:
ffmpeg -i input.mkv -crf 50 -x264-params zones=100,200,b=10.0/300,400,b=20.0 encoded_with_zones.mkv
Настройки такие, чтоб прямо было видно, что работает.

> то есть опять возможно только если кто-то напишет софт которого нет.

--qpfile - низкоуровневый вариант, который можно не трогать, что значит опять?

> по-моему задача вполне нормальна
> А не заниматься любимым линуксятами пердолингом.

Она нормальна, если надо повысить качество как выше. Но первый раз слышу о такой хотелке - исключить из перекодирования избранные части исходника. Потому что это такой пердолинг, который только тебе в голову пришёл. Причём не перекодировать из-за того, что требуется идеальный результат - пиксели трогать нельзя. Нездоровый перфекционизм, который неминуемо ведёт тебя к пердолингу.

> мне казалось проблемы каналов 32 килобита где-то там же где корни дуба.

А чем проблема всплесков битрейта отличается на 4K или 8K?