>Есть такое подозрение что после правки новостей и принятия правок коменты под
>новостью сносятся в ноль, что и порождает такие слухи.Было немало прецедентов

Скорее всего при правке внимание привлекает повальный оффтопик в комментариях, что и приводит к их удалению ;-) Чаще всего обсуждение вырастает из одного оффтопичного комментария, на который нельзя или нет желания закрывать глаза, а так как приктикуется при удалении сообщения удалять и ответы на него, приходится удалять всю нить. Но такое бывает очень редко, это скорее единичные случаи, как и случаи случайного удаления всей нити вместо одного сообщения в ней, при клике не на той ссылке.

Новость с комментариями весьма условно связана, если бы терялась связность - ветка обсуждения все равно оставалась бы висеть в форуме.

Для более подробного анализа пришлите ссылку на новость у которой пропали комментарии, я детально по логам прослежу. Для текущей новости все добавленные комментарии на месте, ничего никто не удалял.