потому что в java есть целый стек технологий EE. К примеру для ORM данных используется Hibernate, DataNucleus или можно по простому с использованием JDBC коннектора к базе данных. При этом можно использовать JNDI интерфейс, это значительно ускоряет работу поскольку используется пул соединений с базой данных. При этом имеем транзакционность на уровне приложения или можно задействовать транзакции даже более глобально, между распределёнными системами используя JTA. И это только часть готового к применению разработчиком стека технологий "javax.persistence." и "javax.transaction.".
То что вы перечислили мне не знакомо, я с этим не работал. Технологий много, помимо стандартного стека Java EE есть ещё всякие фреймворки.
Если вам страшно от ужасов которые вы видели то в этом тоже есть плюс, ведь теперь вы знаете как делать не нужно )