Возможно, что преимуществ прямых нет, если не углубляться в разные бенчмарки, которые так или иначе синтетические и исходят из условий "сферического коня в вакууме".

Я сам думаю, что конечно начинать лучше на open-source решениях, т.к. это минимальные вложения в инструмент, который будет работать неплохо но потребует для тех.персонала более высокую квалификацию и хотя-бы немного творческого мышления. :)

В Windows-only инфраструктуре это разумный способ мигрировать с ОС Windows на сервере на Linux систему в целях экономии на лицензиях для Windows Server. Очень много компаний сидят на MS продуктах, в том числе используют какие-либо готовые либо самописные решения использующие в качестве бэкэнда именно MSSQL и в качестве фронтенда - Windows или продукт под эту систему, переход с которых на Open-source решения потребует значительных расходов времени и финансов. С развитием и популяризацией Linux многие смотрят на эту систему как на панацею от расходов на серверные системы, более того и тех.специалисты - энтузиасты так это представляют руководству. Так что на этот шаг от МС можно посмотреть как на шаг навстречу подобным компаниям. Но опять же - vendor-lock-in остается и клиентские системы всё равно остаются на Windows. Впрочем, я полагаю, что вы и так все это знаете.:)
Вообще интересна ценовая политика MS - будет ли особняком стоять в прайс-листах MSSQL для Linux. :)