> Мне довелось начало 2000-х провести в компании таких машин:
> http://www.morepc.ru/server/sun/netra-t1.html

ну и чего в них было хорошего? стоила как пять тех isp1100, использовала дорогие и тормозные (потому что уже все забили на этот сегмент в low-end железе) uwscsi диски, причем raid, по-моему,  отсутствовал как класс, потому что этих дисков туда помещался целый один (вот подарок-то за те цены), имела процессор раза в два послабее на универсальных задачах (500мегагерцовая ультра vs 700 мегагерцовый тулатин в тех 1100), в остальном примерно им и близка.
Интел в 2004м выкатил isp1400, двуксеон с 4xscsi и почти нормальным по тем временам megaraid.
Полагаю, в этот момент устаревшие нетры и выкинули на свалку окончательно, и oracle с них тоже перетащили на интела.

А, треды с винды скопипастили и пропихнули в стандарт? Ну так это не потому что в тредах было что хорошее (напоминаю, тогдашняя low-end машинка - одноядерная) а потому что, наоборот, sun ниасилила - fork у них был жутко дорогой и медленный, поскольку ни разу не CoW. Пришлось как-то выкручиваться, а вот, кстати, посмотрите-посмотрите, тут у нас как-в-винде!

Но что у вас там были за проблемы с mysql - мне неведомо. Мой десяток разномастых инстансов работал и каши не просил (я чего-то даже и не вспомню - ему вообще в каком году треды стали обязательны, может позже? Хотя нет, кажется уже тогда был только выбор из posix/не posix). Других подобных софтин не было вообще, как-то не принято было без необходимости обмазываться свеженьким, и тем более косплеить винду, а как раз наиболее критичной софтиной был apache, который в системах с дорогим fork проигрывал при заметной нагрузке чуть ли не в полтора раза.
(и с sendmail та же самая история). Виснуть они стали много позже, и это уже была freebsd и совсем другой mysql.

"ко временам 2.6" уже были стандартом многоголовые интелы с ht, поэтому треды все же стали востребованными вне виндомирка и умирающей сановской экосистемы.