1. скрипт не распаковывает всё. хотя наверняка и зипом можно селективно распаковать.
2. чтобы внести правки правильно нужно редактировать AST. вносить правки седом в исходники неправильно и может сломаться в любой момент.
3. вообще я изначально ожидал, что libzip пакует in-place, без копирования архива, просто либо заменяя данные в нужном месте, либо, если не помещаются, бэкапя таблицу в конце, именуемую директорией, добавляя элемент в конец, вставляя после него таблицу, и редактируя в ней запись, чтобы указывала на нововставленный элемент. Но как оказалось, libzip это не делает.

Ещё учтите - виндузятникам, в том числе пользователям "батников", без разницы, качать ли обычный фф, или DE. Поэтому виндузятники не являются target audience. А вот тем, кто пользуется дистрами, нужен именно от дистра, слинкованный с системными либами, и пропатченный под дистр. А почти все линуксовые десктопные дистры зависят от питона, питон там и так есть.