Есть, правда это лишь жалкое подобие реестра, т.к там хранятся только пользовательские настройки и в случае их утери софт просто будет запускаться и работать с дефолтными настройками, в отличии от окон, в которых грохнуть реестр == прощай система.
И снести не сложно: rm ~/.config/dconf/user