> Как разрешения доступа, описываемые в smb.conf, сочетаются с разрешениями доступа к каталогу
> на уровне файловой системы (RWX разрешениями), а также с тем, какой
> пользователь (UID) и группа (GID) являются владельцами каталога на уровне файловой
> системы?

На этот абстрактный вопрос можно только достаточно абстрактный ответ:
1) доступ на уровне шары на всю шару из конфига самбы (видимость/чтение/запись/админ по пользователям самбы);
2) доступ на уровне ФС (RWX по пользователям самбы отображенным в системных пользователей).
Естественно, что если доступ на уровне шары имеется, но на уровне ФС отсутствует всё замечательно пойдет лесом.

PS. Лучше спрашивать конкретные вопросы.