> man du, -x например, не?

Да, спасибо. Можно и так:
du -shx /*
0       /bin
189M    /boot
0       /dev
258M    /etc
44K     /home
0       /lib
0       /lib64
0       /media
0       /mnt
0       /opt
0       /proc
229M    /root
1,4M    /run
0       /sbin
0       /srv
0       /sys
45M     /tmp
5,7G    /usr
7,3G    /var

но сути вопроса это не меняет. Если верить du, в корне занято 13.7Г, а если df, то 45Г. Как бы мне понять, действительно ли что-то занимает 31.3Г...