> да, забыл указать, что в php.ini все верно
> date.timezone = "Europe/Moscow"

http://habrahabr.ru/post/240937/

Если собран с опцией --with-system-tzdata то использует системную, если нет — то нужен модуль timezonedb

pecl install timezonedb
echo "extension=timezonedb.so" > /etc/php5/conf.d/timezonedb.ini

# или, если уже было установлено
pecl upgrade timezonedb