На домашнем сервере Centos 7 тестирую git. До этого никогда с ним не работал. Учусь.

Установил git:
# yum install git

От имени пользователя user1 в его локальной директории сделал папку user1.repo
> git init
> touch file.txt
> echo '123' > file.txt

Ок. Репозиторий готов.

Из под рута (да, я просто тестирую) на этом же компе сделал папку /var/test

# cd /var/test
# git clone /home/user1/user1.repo repo-copy

Ок. Файл file.txt оказался в папке /var/test/repo-copy

Все ок. Изменяю файл file.txt по рутом. Делаю коммит.
# echo '456' > file.txt
# git add file.txt
# git commit -m 'TEST COMMIT'
# git push origin master

Ок, все выходит, git show от рута и от user1 (который типа сам репозиторий держит) показывает, что изменения есть, показывает текст, который я внес в файл.

НО!

Файл file.txt в репозитории (/home/user1/user1.repo) не поменялся, т.е.:
> cat /home/user1/user1.repo

123

а не 456...

Я не понимаю, чего ему надо. Я даже от рута в итоге стал делать коммиты, чтобы точно не права доступа мешали. Как это может быть - коммит принят, а файл не поменялся?

Еще раз отмечаю, что git show и от рута и от user1 показывают одни и те же изменения.

Что это может быть?