Стоит различать менеджеры пакетов (rpm, dpkg...) и репозиториев (apt, yum, zypper, dnf...).

Первые занимаются непосредственно работой с пакетами и ФС, вторые -- планированием изменений как транзакций с учётом всего комплекса зависимостей.

Впрочем, как по мне так утверждение о некритичности производительности/ресурсоёмкости что первого, что второго может позволить себе скорее админ локалхоста, у которого те же чруты из пакетной базы не строятся примерно в любой момент времени, а виртуалки если и есть, то набиты в ящик неплотно -- в общем случае оно неверно.