В статье "Resource Locking with Semaphore Files" рассказано о решении проблемы одновременного доступа к одному ресурсу разными скриптами, в качестве примера приводится простой скрипт - web-счетчик. Предлагается в качестве решения проблемы использовать как flock (FILE, LOCK_EX) блокировку, так и использование технологии с "файлом-семафором".